三、现场审核过程中的文件审核
因受审核方的管理体系文件的数量与详略程度取决于受审核方规模、性质与复杂程度，因此文件审核时调阅的范围、层次及数量与受审核方的规模、性质与复杂程度有关。此外，对文件充分性的判断也需要结合受审核方规模、性质与复杂程度，因此文件审核时调阅的范围、层次及数量与受审核方的规模、性质与复杂程度有关。此外，对文件充分性的判断也需要结合受审核方规模、性质与复杂程度做出，因此，在现场审核过程中，应继续进行深入的管理体系文件审核。
现场审核过程中，除对管理手册和（或）涉及食品安全方针目标、组织结构、职责、食品安全小组成员及职责的文件、程序文件继续进行审核外，还要通过人员沟通、现场观察、文件和记录审查等方式，充分了解受审核方管理体系文件，更加切合实际地分析文件的充分性。其重点审核包括管理手册和（或）涉及食品安全方针目标、组织机构、职责、食品安全小组成员及职责的文件、程序文件、前提方案、操作性前提方案、HACCP计划、原辅料及终产品特性描述、工艺流程图及工艺要求说明、操作规程、食品安全管理制度、食品安全管理制度、食品安全记录等相关文件。
对管理文件的符合性作进一步审核，进一步审核，进一步了解和确认管理体系文件是否完全符合国家相关食品安全法规及标准要求，了解和确认文件与受审核方组织规模、性质和复杂程度的适宜性以及审核目标及范围的一致性，了解和确认文件是否覆盖了审核目标及范围内相关技术要求等等。
有关食品安全管理体系文件，如管理手册和（或）涉及食品安全方针目标、组织结构、职责、食品安全小组成员及职责的文件、程序文件、前提方案、操作性前提方案、HACCP计划、食品安全相关的管理体系文件等，其充分性和适宜性的总体结论，也应在现场审核之后得出。
四、再认证或监督审核的文件审核
再认证或监督审核也必须对文件进行审核，重点审核管理体系文件变化的情况，如文件变化后是否符合国家相关食品安全法律法规和标准要求，与受审核方的组织规模、性质和复杂程度的适宜性以及审核目标及范围的一致性，是否充分覆盖了审核目标及范围的一致性，是否充分覆盖了审核目标及范围内相关技术要求。有关变化的管理体系文件可能包括：管理手册和（或）涉及食品安全方针目标、组织机构、职责、食品安全小组成员及职责的文件、程序文件、前提方案、操作性前提方案、HACCP计划、食品安全相关的技术文件等，其充分性和适宜性的总体结论，同样要在现场审核之后得出。